El doctor Simão Bacamarte, «el més gran dels metges de Brasil, de Portugal i de les Espanyes» decideix fundar a Itaguaí una institució sense precedents locals: una casa de bojos. L?entusiasme inicial de la gent d?Itaguaí deixa pas ben aviat a la sorpresa, quan el metge comença a tancar-hi persones sanes, i s?aixequen les primeres suspicàcies. A mesura que n?hi va tancant més, augmenta la indignació, i finalment esclata una revolta popular. L?alienista, un relat delirant que és al mateix temps una metàfora sobre els límits de la raó humana i una mirada irònica a la societat del seu temps, té un desenllaç, com reconeix el propi autor, «de tanta envergadura i tan inesperat, que es mereixeria almenys deu capítols; però m?acontento amb un, que serà el coronament de la narració i un dels més bells exemples de convicció científica i abnegació humana.»