El universo Cero presenta sus secretos Tras toparse unos con otros en el universo Cero y hacerse con el acorazado del rey demonio Edens Zero, Shiki, Rebecca y Happy se reencuentran entre lágrimas con Witch, visitan a sus antiguos compañeros y van incrementando el número de miembros de su tripulación. Sin embargo, este mundo presenta aspectos distintos de los anteriores. Al descubrirlo, Shiki desea hacerse amigo de sus viejos enemigos de universos previos, Drakken Joe y Poseidon Shura.